機器:(No.089)

遺伝子機能解析・ジェネテイックアナライザ− (ABI-310)

 

管理: 竹上 勉 (総合医学研究所 熱帯医学研究部門 教授)

連絡: 内線3965, 7222

E-mail: takegami@kanazawa-med.ac.jp

機能及び特徴

DNAの塩基配列決定可能。アクリルアミドゲル板の代わりにキャピラリ−を利用している

DNAシ−クエンサ−。少量のDNAを用いて塩基配列を決定することができる。

 

使用方

(1)(前処理) 検体DNAとDNA合成酵素(Taq)入り反応液(BigDye)を混合し、

PCR装置にかけ反応させる。反応液をエタノ−ル沈殿し、専用溶解液(TSR)にて溶かす。

(2)専用チュ−ブに移し、DNAシ−クエンサ−装置(ABI-310)にかける。

(3)約2時間後には400~500塩基を決定することができる。(使用時は管理者に連絡する)

 

利用

デングウイルス遺伝子(全長約10,000ヌクレオチドから成る)構造を明らかにした。

【文献:H Ishak, T Takegami et al.: Comparative Sequences of two type 1 dengue virus

strains possessing different growth characteristics in vitro.

Microbiol. Immunol.  45: 327-331, 2001】