02/03/15
■ 遺伝子の塩基配列を検索したい
【質問】
 検査技師です。実は淋菌のOPA遺伝子をターゲットにPCRで増幅を行うために“Pub Med“から遺伝子の塩基配列を調べたいのですが, どのように検索したらよいのでしょうか?

【回答】
まずは, “Pub Med”を立ち上げます。ここで「Search」モ−ドを通常の「Pub Med」から「Nucleotide」に切り替えます。たったそれだけのことです。あとは, 通常の“Pub Med”と同様の手順で検索して下さい。塩基配列も, 出典の雑誌名も, Accession Numberも示されています。また, 雑誌等からの情報で, 既に目的とする遺伝子塩基配列の登録されている「Accession 番号」が判っている場合は, 検索の欄に, その「Accession 番号」を入力するだけでも情報を入手することが出来ます。
なお, “Pub Med”から以外にも, 国立遺伝学研究所のホ−ムペ−ジ「http://www.nig.ac.jp/home-j.html」または直接に DDBJ (DNA Data Base of Japan) のホ−ムペ−ジ「http://www.ddbj.nig.ac.jp」から検索する方法とがありますが, どちらでも結構です。

(信州大学・川上 由行)

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